靶點驗證新趨勢：競爭性ABPP解析檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹

在新藥研發(fā)中，“靶點篩選"并不意味著“靶點確認"。即使一個候選蛋白在差異表達或通路富集分析中被反復(fù)識別，也不代表它確實是藥物直接作用的靶點。真正關(guān)鍵的問題是：

這個蛋白是否是藥物作用的“直接靶點"？是否存在共價結(jié)合？是否有選擇性抑制？是否存在潛在脫靶？

蛋白zhìzǔxué和分子生物學方法很難直接回答這些問題。而競爭性ABPP（Competitive Activity-Based Protein Profiling），作為ABPP技術(shù)的延伸與強化版本，正在成為靶點驗證領(lǐng)域的新趨勢與新標準。百泰派克生物科技在ABPP平臺基礎(chǔ)上，shuàixiān建立競爭性ABPP分析流程，已廣泛應(yīng)用于新型共價抑制劑、天然產(chǎn)物活性驗證、以及先導(dǎo)化合物脫靶風險評估項目中。

一、什么是競爭性ABPP？

標準ABPP（Activity-Based Protein Profiling）通過共價探針（ABP）標記活性蛋白，結(jié)合質(zhì)譜技術(shù)識別并定量這些活躍酶類，常用于篩選功能蛋白、識別藥物靶點。

競爭性ABPP是一種通過引入藥物競爭機制、增強靶點驗證能力的功能蛋白組學方法。其基本原理是：利用小分子藥物與活性位點探針對同一酶活性中心的“競爭"結(jié)合，推斷藥物是否直接作用于該靶點酶。競爭性ABPP以經(jīng)典ABPP技術(shù)為基礎(chǔ)，但在實驗設(shè)計上引入了關(guān)鍵的“先藥物、后探針"的競爭步驟，其基本流程如下：

1、樣本分組處理，包括藥物處理組與對照組；

2、分別加入ABP探針，進行標準的活性位點標記；

3、富集并酶解dànbáizhì樣本，保留與探針結(jié)合的活性酶；

4、通過質(zhì)譜分析對比兩組中各酶的探針結(jié)合程度；

5、根據(jù)探針信號變化判斷藥物是否與該酶直接競爭結(jié)合。

若某一酶在藥物組中信號顯著降低，則表明藥物對該酶的活性中心具有較強親和力，提示為候選直接靶點。反之，信號不變則說明該酶未被藥物作用或為非靶向結(jié)合。

二、競爭性ABPP的dútè優(yōu)勢

與蛋白組學、化學蛋白zhìzǔxué方法相比，競爭性ABPP展現(xiàn)出多維度的優(yōu)勢：

1、功能導(dǎo)向

競爭性ABPP關(guān)注的是蛋白的活性狀態(tài)而非總量或表達水平，能夠捕捉到在疾病或藥物刺激下真實參與生理過程的“功能性靶點"。

2、結(jié)合事件直接可視化

通過對比藥物干預(yù)前后的探針結(jié)合差異，研究者可直接判斷藥物是否作用于特定酶的催化中心，從而避開傳統(tǒng)驗證路徑中繁瑣的“間接信號解釋"。

3、選擇性與脫靶評估同步完成

競爭性ABPP不僅可以確認藥物是否作用于目標酶，還可以在同一實驗體系中評估其對非目標酶類的作用影響，對優(yōu)化藥物結(jié)構(gòu)、降低毒副風險具有重要參考價值。

4、技術(shù)適配性強

該技術(shù)兼容細胞裂解液、組織勻漿甚至體內(nèi)標記體系，適合在多個模型系統(tǒng)中開展驗證實驗，具備良好的轉(zhuǎn)化能力。

三、為什么競爭性ABPP成為“靶點驗證新標準"？

1、明確識別“直接結(jié)合靶點"

相比差異蛋白篩選方法，競爭性ABPP可直接判斷藥物是否與特定酶發(fā)生物理結(jié)合，是目前zuì可靠的“共價靶點確認手段"。

2、分析藥物選擇性

通過“競爭阻斷程度"評估藥物對不同酶的親和力與選擇性，利于優(yōu)化結(jié)構(gòu)、控制副作用。

3、檢測脫靶效應(yīng)

競爭性ABPP可發(fā)現(xiàn)藥物意外作用的非靶向酶，提示潛在毒性或干擾機制。

4、適配共價藥物開發(fā)路徑

在Ibrutinib、Neratinib、Afatinib等多個共價藥物開發(fā)案例中，競爭性ABPP已被廣泛用于申報前靶點驗證數(shù)據(jù)準備。

百泰派克競爭性ABPP平臺的zhuānyè支持

作為功能蛋白組學方向的核心平臺，百泰派克在競爭性ABPP技術(shù)領(lǐng)域建立了從探針篩選、樣本處理、質(zhì)譜檢測到靶點數(shù)據(jù)解讀的全流程標準服務(wù)體系：

1、支持多種酶類探針，涵蓋sīānsuān酶、半胱天冬酶、金屬蛋白酶等；

2、樣本適配范圍廣泛，支持細胞系、動物組織、人類生物樣本等；

3、定量精度可控，基于高分辨質(zhì)譜平臺進行肽段識別與定量；

4、提供結(jié)合抑制分析報告，包含阻斷率計算、靶點優(yōu)先級排序、GO/KEGG注釋與圖譜化輸出；

5、提供多輪驗證設(shè)計支持，適配結(jié)構(gòu)改進、劑量梯度、時間動態(tài)分析等實驗需求。

傳統(tǒng)靶點研究往往依賴多輪表達驗證與功能推測，難以快速明確藥物與酶類靶點的直接關(guān)系。而競爭性ABPP提供了一種更清晰、更邏輯嚴謹?shù)尿炞C路徑：用“阻斷"證明“結(jié)合"，用“差異"確認“直接作用"。在“表達→功能→作用機制"這一科研認知鏈條中，競爭性ABPP正逐步成為承上啟下的關(guān)鍵技術(shù)環(huán)節(jié)。

百泰派克生物科技特色項目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務(wù)，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務(wù)，對蛋白序列進行分析。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1.采用目前世界上*的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、蛋白zhìzǔxué

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC，提供定量蛋白zhìzǔxué、bǎxiàngdàn白zhìzǔxué、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種蛋白zhìzǔxué分析服務(wù)。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白zhìzǔxué服務(wù)，助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫(yī)學及高通量修飾組學等研究工作。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標記方法，適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實驗結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學分析，分析更系統(tǒng)準確。

三、單細胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進行單細胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析，采用金屬元素標記物（通常是金屬元素標記的特異抗體）標記細胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細胞原理分離單個細胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個細胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細胞表面和內(nèi)部的信號分子表達量。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1.技術(shù)*，*技術(shù)空白

采用金屬標記抗體技術(shù)，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題?？稍趩渭毎麑用嫔蠈Χ喾N指標同時進行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細胞，實現(xiàn)了數(shù)量級的提高，且成本不高于單細胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析，可從zuì小的樣品材料中進行可重復(fù)的識別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF，高效色譜分離技術(shù)，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù)，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務(wù)。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則，通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設(shè)備定期計量/期間核查，軟件審計追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù)，支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測分析服務(wù)；

2.獲國家CNAS實驗室認可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù)；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋蛋白zhìzǔxué、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測平臺，滿足您一站式服務(wù)需求；

5.服務(wù)3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

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