T細胞抗腫瘤戰(zhàn)斗力燃炸的秘密竟在乳酸化修飾！

時間：2024/11/4閱讀：1745

乳酸化是今年國自然的大熱門，風頭無限，頻頻有新機制在頂刊發(fā)表，今天給大家分享乳?；钚卵芯克悸?。

組蛋白乳酸化（Histone Lactylation）通過乳酸的添加修飾組蛋白，從而調節(jié)基因表達及細胞功能。組蛋白乳酸化修飾于2019年被shou次發(fā)現(xiàn)，并迅速在《Nature》上發(fā)表，揭示了細胞代謝與表觀遺傳調控之間的重要聯(lián)系。

組蛋白是核小體的核心組成部分，每個核小體由H2A、H2B、H3和H4組成的八聚體以及纏繞的DNA構成。組蛋白的N端尾部可經(jīng)歷多種翻譯后修飾，如泛素化、SUMO化、乙?；?、丁?；?、甲基化和磷酸化。這些修飾在RNA轉錄、DNA復制及修復等過程中發(fā)揮不同功能，使其在表觀遺傳調控中起著重要作用。

組蛋白的翻譯后修飾通過調節(jié)DNA相關過程，維持細胞內平衡。這些修飾通過改變核小體間接觸或招募非組蛋白來發(fā)揮作用。賴氨酸在特定條件下可以被乳酰化，這一現(xiàn)象稱為組蛋白乳酰化。該修飾在轉錄調控和疾病（特別是腫瘤）中的作用日漸受到關注。

CD8+T細胞，即細胞毒性T淋巴細胞，作為免疫系統(tǒng)中的關鍵角色，負責消滅病原體感染細胞和癌細胞?？乖R別后，初始 CD8 + T 細胞退出靜止狀態(tài)，并經(jīng)歷克隆擴增和效應分化。在靜息狀態(tài)下，T細胞主要依賴線粒體代謝中的三羧酸循環(huán)和氧化磷酸化來滿足能量需求。但一旦活化，T細胞會迅速切換到糖酵解模式，乳酸生成隨之增加。然而，乳酸及其對CD8+T細胞表觀遺傳特征與功能的影響仍不明晰。

2024年10月7日，美國德克薩斯大學安德森癌癥中心在《Nature Immunology》上發(fā)表了一項重要研究，標題為“Histone Lactylation Drives CD8+T Cell Metabolism and Function"。研究發(fā)現(xiàn)，CD8+T細胞關鍵基因的轉錄起始因子顯著調控其功能，揭示了這兩種修飾在塑造CD8+T細胞特性與功能中的du特作用。研究表明，乳酸依賴性組蛋白乳?；ㄟ^調節(jié)表觀遺傳和轉錄重塑來調節(jié)CD8 + T 細胞的代謝和功能。

CD8+T細胞在激活時由線粒體代謝轉向糖酵解，乳酸不僅抑制效應細胞功能，還可能增強干細胞樣CD8+ T細胞的抗腫瘤免疫功能。團隊主要探討了組蛋白乳酰化在CD8+ T細胞中的作用，發(fā)現(xiàn)H3K18和H3K9乳?；诩せ畹腃D8+ T細胞中富集，與基因轉錄和效應功能相關。抑制乳?；瘯魅魿D8+ T細胞效應功能，而促進乳?；瘎t增強抗腫瘤免疫，表明組蛋白乳?；贑D8+ T細胞抗腫瘤免疫中起關鍵調控作用。

乳酸衍生的組蛋白乳?；疕3K18la和H3K9la在CD8+ T細胞的轉錄、代謝和抗腫瘤免疫中起重要作用，反映出表觀遺傳與代謝途徑在T細胞功能中的動態(tài)互作。這為提升抗腫瘤免疫療法的效果提供了新的潛在策略。

T細胞活化驅動組蛋白乳?；?/strong>

研究人員首先探討了H3K18la和H3K9la在CD8+T細胞中的相關性。通過流式細胞術分析，發(fā)現(xiàn)活化的CD8+T細胞相比于初始細胞，其H3K18la和H3K9la乳?；斤@著升高，并且這種增加具有抗原特異性，與T細胞的活化狀態(tài)成正相關。特異性抗原刺激顯著增強這些組蛋白修飾。此外，這一發(fā)現(xiàn)也在小鼠模型中得到了驗證。

圖1 細胞活化驅動組蛋白乳?；?/span>

進一步使用抗原特異性T細胞反應模型，研究表明刺激抗原特異性CD8+T細胞能夠顯著增強H3K18la和H3K9la的水平。相較之下，在T細胞活化缺陷的小鼠模型（Bhlhe40敲除小鼠）中，這兩種修飾的水平顯著降低。在表達特定抗原的腫瘤模型中，研究者觀察到與對照組相比，CD8+T細胞中的H3K18la和H3K9la水平更高，且腫瘤生長受到抑制。

這些結果證明了T細胞活化與組蛋白乳酰化之間存在直接關聯(lián)，揭示了組蛋白乳酰化在免疫應答中的重要作用。

H3K18la和H3K9la驅動CD8+T細胞的轉錄

通過ChIP-seq分析發(fā)現(xiàn)，富含H3K18la或H3K9la標記的染色質區(qū)域展現(xiàn)出與活性轉錄相關的染色質狀態(tài)模式。這些標記在轉錄起始位點（TSS）區(qū)域及CpG島附近顯著富集，且與其他轉錄激活的組蛋白修飾共存，表明它們在轉錄起始和基因表達調節(jié)中發(fā)揮重要作用。在CD8+T細胞從初始狀態(tài)轉變?yōu)榧せ顮顟B(tài)的過程中，H3K18la和H3K9la標記在啟動子和增強子區(qū)域顯示出動態(tài)變化。

此外，相較于單獨使用其他活性PTM標記的區(qū)域，攜帶H3K18la和H3K9la標記的啟動子和增強子區(qū)域顯示出更高的RNA聚合酶II（RNApol II）占有率，表明二者在驅動CD8+T細胞轉錄方面存在協(xié)同效應。結合RNA-seq數(shù)據(jù)的BETA分析顯示，H3K18la和H3K9la標記的啟動子區(qū)域分別富集于Ets轉錄因子和鋅指轉錄因子結合的基序，這些轉錄因子在CD8+T細胞的分化、穩(wěn)態(tài)和功能中扮演著重要角色。H3K18la標記了關鍵的T細胞活化基因，如Stat1、Cd28和Icos，而H3K9la則富集于與免疫效應相關的基因，如Ifng。

這些結果揭示了H3K18la和H3K9la在CD8+T細胞轉錄調控中的關鍵作用，強調了組蛋白乳酸化在免疫應答中的重要性。

圖2 組蛋白乳酸化調節(jié)CD8+T細胞的轉錄起始

H3K9la 和 H3K18la在CD8+T細胞中作用不同

研究人員分析了H3K18la和H3K9la在CD8+T細胞不同分化階段的富集模式及其對基因表達的調控作用。結果表明，在初始CD8+T細胞中，H3K9la主要富集于維持T細胞靜息狀態(tài)的基因，而在活化狀態(tài)下，H3K18la則顯著富集于效應基因，顯示出兩者在T細胞活化過程中的不同功能。GSEA分析顯示，H3K18la與炎癥反應和JAK–STAT信號通路相關，而H3K9la則與氧化磷酸化和細胞因子信號相關。在記憶CD8+ T細胞中，H3K9la與脂肪酸代謝相關。H3K9la在記憶CD8+T細胞中繼續(xù)發(fā)揮重要作用，調節(jié)與T細胞功能相關的基因，而H3K18la的富集則相對較少。

圖3 H3K9la 和 H3K18la在CD8+T細胞中的不同作用

通過GSEA（基因集富集分析），研究還發(fā)現(xiàn)H3K18la與T細胞活化過程中涉及的炎癥反應和糖酵解代謝途徑相關，而H3K9la則與氧化磷酸化、線粒體呼吸以及記憶T細胞中的脂肪酸代謝途徑緊密相關。這不僅強調了H3K18la和H3K9la在調節(jié)T細胞線粒體動力學和能量代謝中的關鍵作用，還揭示了它們在不同T細胞狀態(tài)下對基因表達的差異化調控。

總體而言，H3K18la和H3K9la在決策T細胞功能和代謝方面展現(xiàn)了相輔相成卻又各自du特的調控機制。

圖4 組蛋白乳酸化與細胞代謝

組蛋白乳酸化與細胞代謝的關聯(lián)

激活的CD8+T細胞依賴糖酵解，而初始與記憶T細胞更依賴線粒體代謝。抑制乳酸的生成可降低H3K18la和H3K9la的水平。研究還發(fā)現(xiàn)，外源性乳酸處理在初始和記憶T細胞中增加了這兩種乳?；瘶擞?，而在激活的T細胞中無明顯影響。

H3K18la和H3K9la與CD8+ T細胞功能的關系密切。LDHA抑制導致H3K18la和H3K9la降低，減弱效應基因表達及腫瘤殺傷能力。相反，抑制HDAC則增加這兩種乳酰化水平，增強抗腫瘤免疫。

圖5 機制圖解

討論與展望

本研究明確了H3K18la和H3K9la在CD8+ T細胞調節(jié)中的重要性。在體外培養(yǎng)的人CD8+ T細胞和小鼠CD8+ T細胞中，H3K18la和H3K9la富集。作者還證實了在移植物抗宿主?。℅vHD）和腫瘤模型中，CD8+ T細胞組蛋白乳?；南嚓P性。這兩種組蛋白乳酸化標記可以單獨作用，也可以與其他組蛋白修飾聯(lián)合發(fā)揮作用，顯示組蛋白乳酸化與其他組蛋白修飾在塑造CD8+ T細胞轉錄譜中的復雜互動。然而，組蛋白乳酸化與其他修飾的時空相互作用的細節(jié)仍需進一步研究。

此外，作者發(fā)現(xiàn)內源性糖酵解驅動激活CD8+ T細胞中的H3K18la和H3K9la，而線粒體代謝途徑（如TCA循環(huán)、脂肪酸氧化（FAO）和ACLY）對記憶CD8+ T細胞中的H3K9la也有幫助。值得注意的是，由于糖酵解生成的丙酮酸轉化為乳酸，激活的CD8+ T細胞中的電子傳遞鏈（ETC）抑制會增加組蛋白乳?；Ｏ喾?，記憶CD8+ T細胞依賴氧化磷酸化（OXPHOS）和FAO，ETC和FAO的抑制，這會減少TCA循環(huán)中間體（如草酰乙酸和蘋果酸）的產生，從而影響丙酮酸與乳酸的生成，進而會弱化H3K9la。這突顯了糖酵解與線粒體代謝在形塑組蛋白乳?；Ｊ街械膹碗s交互，需要未來研究探討不同代謝途徑中乳酸如何調節(jié)特定的組蛋白乳?；瘶擞洝?/span>

外源性乳酸不影響活化CD8+ T細胞中的H3K18la和H3K9la水平，但對初始和記憶CD8+ T細胞有影響，這可能與這些亞群的不同代謝特征有關。在T細胞激活期間，內源性乳酸的高產生可能使CD8+ T細胞中的H3K18la和H3K9la水平達到飽和，進而抑制外源性乳酸的進一步影響。此外，MCT通道會將黏附在細胞內的高水平乳酸排出，減少組蛋白乳酰化。反之，在初始CD8+ T細胞中，較低的細胞內乳酸水平使得MCT能夠輸入外源乳酸，從而增強組蛋白乳酰化。此外，耗竭的CD8+ T細胞組蛋白乳?；浇档?，而H3K9ac這些耗竭相關基因被標記。本研究為闡明組蛋白乳酰化在CD8+ T細胞基因轉錄中的重要性奠定了基礎。

作者還調節(jié)了已知的組蛋白乳酸化“寫入因子"和“去除因子"，以證明其在激活CD8+ T細胞中的基因表達和功能調節(jié)中的作用。由于這些抑制劑影響乳?；鸵阴；髡呓Y合了ChIP-seq和RNA-seq數(shù)據(jù)以闡明每種組蛋白修飾對RNApol II招募和基因轉錄的貢獻。綜合分析顯示，組蛋白乳?；cRNApol II的富集密切相關，對關鍵T細胞基因的調控潛力更大，相較于組蛋白甲基化或乙?；ｉ_發(fā)特異性抑制劑，精確靶向這些組蛋白修飾的未來研究或能解決仍存在的挑戰(zhàn)。

總之，該研究揭示了H3K18la和H3K9la在CD8+T細胞中的重要作用，不同的CD8+T細胞亞群中H3K18la和H3K9la的富集模式各異，且與其特定的代謝特征緊密相關。這些發(fā)現(xiàn)深化了對T細胞活化過程中代謝調控的理解，并為未來開發(fā)針對T細胞代謝的免疫治療策略提供了新的思路。通過針對這些組蛋白乳?；瘶擞浀恼{控，可能有助于優(yōu)化T細胞的功能，從而提升免疫療法的效果。

T細胞代謝與免疫治療的其他思路

1. 代謝靶向治療：通過調控T細胞的代謝特性，來增強其抗腫瘤功能。例如，靶向糖酵解或脂肪酸代謝的藥物可能有助于提高T細胞抗腫瘤的效應。

2. 微環(huán)境調節(jié)：在腫瘤微環(huán)境中，乳酸會抑制T細胞的功能。開發(fā)能有效清除腫瘤微環(huán)境中乳酸的藥物，可以改善T細胞的抗腫瘤反應。

3. 細胞代謝重編程：工程化T細胞以增強其代謝能力，從而提高其在腫瘤微環(huán)境中的生存和功能。例如，轉基因細胞能夠更有效地利用乳酸作為能量來源。

4. 聯(lián)合免疫療法：將代謝調節(jié)藥物與免疫檢查點抑制劑結合使用，可能會增強T細胞對腫瘤的免疫應答。通過同時改變代謝狀態(tài)和解除免疫抑制，可能會實現(xiàn)更強的腫瘤療效。

總之，理解組蛋白乳?；贑D8+ T細胞代謝中的作用，不僅為作者揭示了細胞功能調控的新機制，也為免疫治療提供了新的思路和策略。

參考文獻：

【1】Raychaudhuri, D., Singh, P., Chakraborty, B. et al. Histone lactylation drives CD8+ T cell metabolism and function. Nat Immunol (2024). doi:10.1038/s41590-024-01985-9

【2】Sun, R., Chi, H. Metabolic-epigenetic rewiring in CD8+ T cells via lactate-dependent histone lactylation. Nat Immunol (2024). doi:10.1038/s41590-024-01991-x

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